W uznaniu za wyjątkowe dokonania artystyczne i realizację licznych inicjatyw twórczych wzbogacających życie kulturalne miasta, profesor Stanisław Baj został odznaczony przez Prezydenta Miasta Lublin Medalem Unii Lubelskiej.
Nagrodę tą ustanowiono w 1999 roku podczas uroczystych obchodów 430-lecia Unii Lubelskiej. Medal jest wręczany osobom szczególnie zasłużonym dla Lublina na polu międzynarodowym, a dana osoba, instytucja lub organizacja może zostać nim wyróżniona jednokrotnie.